Seznam mikrobiot

 

Seznam se průběžně upravuje a doplňuje.

 

Název Fotka Klasifikace Sekvence 16S RNA
Akkermansia muciniphila 78 Kmen: Verrucomicrobia 78
Tříta: Verrucomicrobiae
Řád: Verrucomicrobiales
Čeleď: Rikenellaceae
Alistipes onderdonkii 37, 90, 96, 104, 108, 110, 140, 145 Kmen: Bacteroidetes 37, 90, 96, 104, 108, 110, 140, 145
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Rikenellaceae
Alistipes putredinis 89, 94, 99 Kmen: Bacteroidetes 89, 94, 99
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Rikenellaceae
Alistipes senegalensis 31a, 66, 73, 74, 79, 102, 106, 111, 116, 123, 125, 130, 137, 139, 141, 146, 159, 167, 198, 504,  Kmen: Bacteroidetes 31a, 66, 73, 74, 79, 102, 106, 111, 116, 123, 125, 130, 137, 139, 141, 146, 159, 167, 198, 504, 
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Rikenellaceae
Alistipes shahii 31b, 54 Kmen: Bacteroidetes 31b, 54
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Rikenellaceae
Anaerofilum agile 201 Kmen: Firmicutes 201
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Anaeromassilibacilus senegalensis 200, 250, 252, 257, 258, 259, 262, 265 Kmen: Firmicutes 200, 250, 252, 257, 258, 259, 262, 265
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Anaerotruncus colihominis 174, 175, 247, 251, 253, 254, 255, 263 Kmen: Firmicutes 174, 175, 247, 251, 253, 254, 255, 263
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Bacillus licheniformis 246, 441 Kmen: Firmicutes 246, 441
Třída: Bacilli
Řád: Bacillales
Čeleď: Bacillaceae
Bacteroides caecicola 768 Kmen: Bacteroidetes 768
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides caecigallinarum 406, 410,412, 422, 428, 462, 561 Kmen: Bacteroidetes 406, 410,412, 422, 428, 462, 561
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides clarus 43, 189 Kmen: Bacteroidetes 43, 189
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides coprocola 589, 716, 767 Kmen: Bacteroidetes 589, 716, 767
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides dorei 16, 41, 83, 113, 160 Kmen: Bacteroidetes 16, 41, 83, 113, 160
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides eggerthii 193 Kmen: Bacteroidetes 193
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides ovatus 161 Kmen: Bacteroidetes 161
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides plebeius  426, 475, 584 Kmen: Bacteroidetes 426, 475, 584
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides salanitronis 19, 51a, 51b, 269, 279, 322, 558 Kmen: Bacteroidetes 19, 51a, 51b, 269, 279, 322, 558
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides uniformis 67 Kmen: Bacteroidetes 67
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Bacteroides xylanisolvens 107, 109, 126 Kmen: Bacteroidetes 107, 109, 126
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Barnesiella viscericola 22, 36, 55, 393, 684 Kmen: Bacteroidetes 22, 36, 55, 393, 684
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Porphyromonadaceae
Bifidobacterium adolescentis 157 Kmen: Actinobacteria 157
Třída: Actinobacteria
Řád: Bifidobacteriales
Čeleď: Bifidobacteriaceae
Bifidobacterium bifidum 182 Kmen: Actinobacteria 182
Třída: Actinobacteria
Řád: Bifidobacteriales
Čeleď: Bifidobacteriaceae
Bifidobacterium dentium 147 Kmen: Actinobacteria 147
Třída: Actinobacteria
Řád: Bifidobacteriales
Čeleď: Bifidobacteriaceae
Bifidobacterium gallinarum 162, 312, 616, 634, 652, 655, 665, 670, 672, 674, 686 Kmen: Actinobacteria 162, 312, 616, 634, 652, 655, 665, 670, 672, 674, 686
Třída: Actinobacteria
Řád: Bifidobacteriales
Čeleď: Bifidobacteriaceae
Bifidobacterium pseudolongum 236 Kmen: Actinobacteria 236
Třída: Actinobacteria
Řád: Bifidobacteriales
Čeleď: Bifidobacteriaceae
Bifidobacterium saeculare 272, 274, 314, 609, 660, 775 Kmen: Actinobacteria 272, 274, 314, 609, 660, 775
Třída: Actinobacteria
Řád: Bifidobacteriales
Čeleď: Bifidobacteriaceae
Blautia coccoides 46a, 46b Kmen: Firmicutes 46a, 46b
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Lachnospiraceae
Blautia producta 81, 626, 643, 661, 678, 688 Kmen: Firmicutes 81, 626, 643, 661, 678, 688
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Lachnospiraceae
Blautia schinkii 249, 261 Kmen: Firmicutes 249, 261
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Lachnospiraceae
Butyricicoccus pullicaecorum 179, 180 Kmen: Firmicutes 179, 180
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Butyricimonas paravirosa 62 Kmen: Bacteroidetes 62
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Porphyromonadaceae
Cloacibacillus porcorum 23 Kmen: Synergistetes 23
Třída: Synergistia
Řád: Synergistales
Čeleď: Synergistaceae
Clostridium diolis 318 Kmen: Firmicutes 318
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium glycyrrhizinilyticum  76, 169, 298, 427, 591, 633 Kmen: Firmicutes 76, 169, 298, 427, 591, 633
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium hylemonae 156 Kmen: Firmicutes 156
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium indolis 325 Kmen: Firmicutes 325
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium lactatifermentans 75, 114, 390, 417, 420a, 424, 431a, 437, 484, 486, 494, 496, 509, 514, 515 Kmen: Firmicutes 75, 114, 390, 417, 420a, 424, 431a, 437, 484, 486, 494, 496, 509, 514, 515
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium oroticum 181 Kmen: Firmicutes 181
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium perfringenst 68, 185 Kmen: Firmicutes 68, 185
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium ramosum 195 Kmen: Firmicutes 195
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium saccharolyticum 14, 168, 196 Kmen: Firmicutes 14, 168, 196
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium saudiense  435 Kmen: Firmicutes 435
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium spiroforme 15, 26, 149, 158, 173, 433a, 438, 497, 567,  Kmen: Firmicutes 15, 26, 149, 158, 173, 433a, 438, 497, 567, 
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Clostridium xylanolyticum 56 Kmen: Firmicutes 56
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Collinsella aerofaciens 17 Kmen: Actinobacteria 17
Třída: Coriobacteriia
Řád: Coriobacteriales
Čeleď: Coriobacteriaceae
Collinsella intestinalis 1, 7, 268, 307 Kmen: Actinobacteria 1, 7, 268, 307
Třída: Coriobacteriia
Řád: Coriobacteriales
Čeleď: Coriobacteriaceae
Collinsella tanakaei  2, 271, 368, 682 Kmen: Actinobacteria 2, 271, 368, 682
Třída: Coriobacteriia
Řád: Coriobacteriales
Čeleď: Coriobacteriaceae
Cutibacterium acnes 326 Kmen: Actinobacteria 326
Třída: Actinobacteria
Řád: Propionibacteriales
Čeleď: Propionibacteriaceae
Desulfovibrio desulfuricans 276 Kmen: Proteobacteria 276
Třída: Deltaproteobacteria
Řád: Desulfovibrionales
Čeleď: Desulfovibrionaceae
Desulfovibrio piger 401, 418, 598, 698, 709, 710 Kmen: Proteobacteria 401, 418, 598, 698, 709, 710
Třída: Deltaproteobacteria
Řád: Desulfovibrionales
Čeleď: Desulfovibrionaceae
Dielma fastidiosa 132 Kmen: Firmicutes 132
Třída: Erysipelotrichia
Řád: Erysipelotrichales
Čeleď: Erysipelotrichaceae
Drancourtella massiliensis 12, 57, 177, 210, 701, 770 Kmen: Firmicutes 12, 57, 177, 210, 701, 770
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Eggerthella lenta 231b, 240 Kmen: Actinobacteria 231b, 240
Třída: Coriobacteriia
Řád: Eggerthellales
Čeleď: Eggerthellaceae
Elusimicrobium minutum 273 Kmen: Elusimicrobia 273
Třída: Elusimicrobia
Řád: Elusimicrobiales
Čeleď: Elusimicrobiaceae
Enorma massiliensis 70, 154, 155, 164, 340a, 679 Kmen: Actinobacteria 70, 154, 155, 164, 340a, 679
Třída: Coriobacteriia
Řád: Coriobacteriales
Čeleď: Coriobacteriaceae
Enorma timonensis 5, 8, 18 Kmen: Actinobacteria 5, 8, 18
Třída: Coriobacteriia
Řád: Coriobacteriales
Čeleď: Coriobacteriaceae
Enterococcus casseliflavus 163, 191 Kmen: Firmicutes 163, 191
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Enterococcaceae
Enterococcus cecorum 69, 144, 483, 622, 662, 676 Kmen: Firmicutes 69, 144, 483, 622, 662, 676
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Enterococcaceae
Enterococcus gallinarum 774 Kmen: Firmicutes 774
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Enterococcaceae
Escherichia fergusonii 190 Kmen: Proteobacteria 190
Třída: Gammaproteobacteria
Řád: Enterobacterales
Čeleď: Enterobacteriaceae
Ethanoligenens harbinense 264 Kmen: Firmicutes 264
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Eubacterium hallii 3, 11 Kmen: Firmicutes 3, 11
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Eubacteriaceae
Faecalibacterium prausnitzii 58, 86, 121, 122, 192, 585 Kmen: Firmicutes 58, 86, 121, 122, 192, 585
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Faecalicatena contortum 118, 640 Kmen: Firmicutes 118, 640
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Lachnospiraceae
Faecalicatena fissicatena 131, 133, 138 Kmen: Firmicutes 131, 133, 138
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Lachnospiraceae
Faecalicoccus acidiformans 423 Kmen: Firmicutes 423
Třída: Erysipelotrichia
Řád: Erysipelotrichales
Čeleď: Erysipelotrichaceae
Faecalicoccus pleomorphus 305, 308, 309, 323, 618, 721, 766 Kmen: Firmicutes 305, 308, 309, 323, 618, 721, 766
Třída: Erysipelotrichia
Řád: Erysipelotrichales
Čeleď: Erysipelotrichaceae
Faecalitalea cylindroides 64, 103, 165, 178, 313, 320, 367, 482, 639, 765 Kmen: Firmicutes 64, 103, 165, 178, 313, 320, 367, 482, 639, 765
Třída: Erysipelotrichia
Řád: Erysipelotrichales
Čeleď: Erysipelotrichaceae
Flavonifractor plautii 4, 9, 10, 52, 82, 91, 92, 95, 100, 112, 135, 186, 248, 256, 267, 306, 436, 520, 603, 645, 702, 725, 727, 764 Kmen: Firmicutes 4, 9, 10, 52, 82, 91, 92, 95, 100, 112, 135, 186, 248, 256, 267, 306, 436, 520, 603, 645, 702, 725, 727, 764
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: -
Fusobacterium mortiferum 397, 403, 409, 425 Kmen: Fusobacteria 397, 403, 409, 425
Třída: Fusobacteriia
Řád: Fusobacteriales
Čeleď: Fusobacteriaceae
Gallibacterium anatis 346 Kmen: Proteobacteria 346
Třída: Gammaproteobacteria
Řád:  Pasteurellales
Čeleď: Pasteurellaceae
Gemmiger formicilis 50, 87, 88, 120, 194, 578 Kmen: Firmicutes 50, 87, 88, 120, 194, 578
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Gordonibacter urolithinfaciens 230, 232, 233a, 234a, 237, 238, 239, 241, 242, 245 Kmen: Actinobacteria 230, 232, 233a, 234a, 237, 238, 239, 241, 242, 245
Třída: Coriobacteriia
Řád: Eggerthellales
Čeleď: Eggerthellaceae
Hydrogenoanaerobacterium saccharovorans  564 Kmen: Firmicutes 564
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Intestinimonas butyriciproducens  503, 565 Kmen: Firmicutes 503, 565
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: -
Lactobacillus acidophilus 275, 343 Kmen: Firmicutes 275, 343
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus agilis 358, 590b, 650, 658, 668 Kmen: Firmicutes 358, 590b, 650, 658, 668
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus amylovorus 296 Kmen: Firmicutes 296
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus aviarius 347, 350, 532 Kmen: Firmicutes 347, 350, 532
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus coleohominis  526, 527, 574 Kmen: Firmicutes 526, 527, 574
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus crispatus 336, 373, 552, 724, 726, 729 Kmen: Firmicutes 336, 373, 552, 724, 726, 729
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus gallinarum 101, 115, 117, 119, 153, 303, 304, 311, 315, 338, 447 Kmen: Firmicutes 101, 115, 117, 119, 153, 303, 304, 311, 315, 338, 447
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus gasseri 197 Kmen: Firmicutes 197
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus ingluviei 443, 593, 681, 777 Kmen: Firmicutes 443, 593, 681, 777
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus johnsonii 171, 297, 340 Kmen: Firmicutes 171, 297, 340
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus kitasatonis 294, 384, 458, 479 Kmen: Firmicutes 294, 384, 458, 479
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus oris 301, 316 Kmen: Firmicutes 301, 316
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus reuteri 21, 28, 71, 151, 166, 554, 694, 769 Kmen: Firmicutes 21, 28, 71, 151, 166, 554, 694, 769
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus saerimneri 299, 374 Kmen: Firmicutes 299, 374
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus salivarius 34, 48, 49, 60, 63, 65, 84, 128, 321, 334, 453, 474, 647, 651,  Kmen: Firmicutes 34, 48, 49, 60, 63, 65, 84, 128, 321, 334, 453, 474, 647, 651, 
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus vaginalis 337, 683 Kmen: Firmicutes 337, 683
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Lactobacillaceae
Massiliomicrobiota timonensis 13, 80, 105, 134, 142, 606, 632, 695, 731 Kmen: Firmicutes 13, 80, 105, 134, 142, 606, 632, 695, 731
Třída: Erysipelotrichia
Řád: Erysipelotrichales
Čeleď: Erysipelotrichaceae
Mediterranea massiliensis  20, 27, 47, 53, 421, 502, 604, 642, 772 Kmen: Bacteroidetes 20, 27, 47, 53, 421, 502, 604, 642, 772
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Bacteroidaceae
Megamonas funiformis 776 Kmen: Firmicutes 776
Třída: Negativicutes
Řád: Selenomonadales
Čeleď: Selenomonadaceae
Megamonas hypermegale 288, 400, 649 Kmen: Firmicutes 288, 400, 649
Třída: Negativicutes
Řád: Selenomonadales
Čeleď: Selenomonadaceae
Megamonas sp. 610, 638, 690 Kmen: Firmicutes 610, 638, 690
Třída: Negativicutes
Řád: Selenomonadales
Čeleď: Selenomonadaceae
Megasphaera elsdenii 286, 586, 600, 648, 656, 673, 693, 697, 707, 711, 717, 771 Kmen: Firmicutes 286, 586, 600, 648, 656, 673, 693, 697, 707, 711, 717, 771
Třída: Negativicutes
Řád: Veillonellales
Čeleď: Veillonellaceae
Mordavella massiliensis 420c, 499, 582 Kmen: Firmicutes 420c, 499, 582
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Clostridiaceae
Muribaculum intestinale 287, 289 Kmen: Bacteroidetes 287, 289
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Muribaculaceae
Muricomes intestini 773 Kmen: Firmicutes 773
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Lachnospiraceae
Mycoplasma arginini 38, 459 Kmen: Tenericutes 38, 459
Třída: Mollicutes
Řád: Mycoplasmatales
Čeleď: Mycoplasmataceae
Odoribacter splanchnicus 39, 45, 72, 129, 152 Kmen: Bacteroidetes 39, 45, 72, 129, 152
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Odoribacteraceae
Olsenella uli 188, 270, 285, 290, 293 Kmen: Actinobacteria 188, 270, 285, 290, 293
Třída: Coriobacteriia
Řád: Coriobacteriales
Čeleď: Atopobiaceae
Oscillibacter valericigenes  411, 563 Kmen: Firmicutes 411, 563
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Oscillospiraceae
Parabacteroides distasonis 199 Kmen: Bacteroidetes 199
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Tannerellaceae
Parabacteroides johnsonii 6, 32, 42, 124, 127, 150 Kmen: Bacteroidetes 6, 32, 42, 124, 127, 150
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Tannerellaceae
Parabacteroides merdae 170, 277 Kmen: Bacteroidetes 170, 277
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Tannerellaceae
Parasutterella secunda  562 Kmen: Proteobacteria 562
Třída: Betaproteobacteria
Řád: Burkholderiales
Čeleď: Sutterellaceae
Phocea massiliensis  559 Kmen: Firmicutes 559
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Prevotella loescheii 495 Kmen: Bacteroidetes 495
Třída: Bacteroidia
Řád: Bacteroidales
Čeleď: Prevotellaceae
Pseudoflavonifractor capillosus 44, 85, 148, 176, 183, 187, 386 Kmen: Firmicutes 44, 85, 148, 176, 183, 187, 386
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: -
Pseudoflavonifractor phocaeensis   431c, 510, 513, 570, 433b, 434b, 485, 491, 493, 507, 568, 569 Kmen: Firmicutes 431c, 510, 513, 570, 433b, 434b, 485, 491, 493, 507, 568, 569
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: -
Ruminococcus gnavus 136 Kmen: Firmicutes 136
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Lachnospiraceae
Ruminococcus torques 59, 61, 595 Kmen: Firmicutes 59, 61, 595
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Lachnospiraceae
Staphylococcus saprophyticus 209 Kmen: Firmicutes 209
Třída: Bacilli
Řád: Bacillales
Čeleď: Staphylococcaceae
Streptococcus alactolyticus 25, 669 Kmen: Firmicutes 25, 669
Třída: Bacilli
Řád: Lactobacillales
Čeleď: Streptococcaceae
Subdoligranulum variabile 93 Kmen: Firmicutes 93
Třída: Clostridia
Řád: Clostridiales
Čeleď: Ruminococcaceae
Veillonella magna 354, 537, 657, 671 Kmen: Firmicutes 354, 537, 657, 671
Třída: Negativicutes
Řád: Veillonellales
Čeleď: Veillonellaceae